Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scarb1Q61009 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarb1Q61009 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb1Q61009 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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