Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms