Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp7Q60973 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms