Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DbpQ60925 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DbpQ60925 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms