Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms