Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms