Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PmelQ60696 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PmelQ60696 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms