Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3aQ60520 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sin3aQ60520 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3aQ60520 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms