Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd5Q5VCS6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms