Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms