Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf1Q5U4C3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms