Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdcp1Q5U462 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms