Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rabl6Q5U3K5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rabl6Q5U3K5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms