Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms