Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms