Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms