Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc85aQ5SP85 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms