Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CoblQ5NBX1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CoblQ5NBX1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms