Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3kQ5GIG6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3kQ5GIG6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms