Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20816Q5FWD4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms