Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpm3Q5F4S9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms