Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkaa1Q5EG47 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkaa1Q5EG47 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms