Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nlrc3Q5DU56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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