Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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