Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms