Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc84Q4VA36 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc84Q4VA36 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms