Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc27a5Q4LDG0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc27a5Q4LDG0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms