Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt35Q497I4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms