Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Carmil2Q3V3V9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms