Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pydc3Q3V3Q4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pydc3Q3V3Q4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pydc3Q3V3Q4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pydc3Q3V3Q4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pydc3Q3V3Q4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms