Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms