Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Garnl3Q3V0G7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms