Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc114Q3UX62 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc114Q3UX62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms