Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm27235Q3UW50 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm27235Q3UW50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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