Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ScimpQ3UU41 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms