Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thsd4Q3UTY6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thsd4Q3UTY6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms