Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28047Q3US59 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28047Q3US59 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms