Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms