Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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