Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cog7Q3UM29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms