Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxosQ3UL53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxosQ3UL53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxosQ3UL53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxosQ3UL53 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxosQ3UL53 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxosQ3UL53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxosQ3UL53 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms