Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp19Q3UJD6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp19Q3UJD6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms