Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc34Q3UI66 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc34Q3UI66 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms