Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6cQ3UHC0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms