Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Puf60Q3UEB3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Puf60Q3UEB3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms