Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms