Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U595 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U595 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U595 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U595 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U595 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U595 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U595 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U595 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U595 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q3U595 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q3U595 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U595 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms