Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VwceQ3U515 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms