Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hectd3Q3U487 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms