Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U1D9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms